值得注意的是，曾被市场寄予厚望的高校上市公司，整体经营并不见佳。2001年前上市且2010年仍由高校控股的16家公司中，平均年净资产增长率大于20%的仅有4家、平均年净利润增长率大于20%的仅有2家。业内人士称，这与高校系上市公司缺乏激励机制、人事关系复杂等因素有关，而这亦是国企难以发展的通病。

　　北大系四大上市公司

　　在拥有上市公司的13所国内高校中，北大、清华无疑是执牛耳者。

　　北京大学现有4家上市公司，分别为方正科技、中国高科、北大医药、方正证券。其中中国高科、方正证券为IPO上市。

　　中国高科的控股股东为北大方正集团。虽然顶着“高科”的名字，但公司目前主营业务却是商品房销售，2012年营收占比高达74.26%。公司董事长由北大方正集团有限公司总裁余丽担任。

　　让人大跌眼镜的是，这家原本由36所高校共同组建的上市公司，上市已经18年，却一直未实现当初成立时的夙愿。北大方正入主后，2003年1月，公司由上海浦东迁址到北京海淀，公司主营业务已经基本与“中国高科”四个字没有关联。

　　北大系上市公司的旗舰是方正证券。方正证券的前身为浙江证券，2003年北大方正入主后更名。2008年，方正证券由杭州迁址长沙，同时吸收合并湖南本土券商泰阳证券。2011年8月，方正证券上市。截至3月18日收盘，在国内21家A股上市券商中，方正证券以333亿市值排名第六位，其也是 25家高校系上市公司中市值最大的一家。

　　方正证券目前控制合资券商瑞信方正、方正期货、方正和生、方正富邦等公司，系方正金融版图中最重要的一枚棋子。

　　与中国高科、方正证券不同，方正科技、北大医药为借壳上市。方正科技的前身为上海老八股之一的延中实业，1990年12月上市。1998年5 月，以方正集团为代表的北京大学所属关联企业举牌延中实业，并控制董事会。次年，延中实业更名为方正科技，公司主营业务变更为电脑及相关产品。公司董事长，由北大方正集团副总裁易梅担任。

　　北大医院的前身为西南合成，位于重庆。1997年在深交所挂牌上市后，西南合成长期处于亏损状态。2003年，北大方正入主。2009年，西南合成实施定向增发，北大方正集团旗下公司北大国际医院集团，将其控制的大新药业注入公司。2011年，西南合成实施第二次定向增发，北大国际医院集团又将北医医药注入，西南合成从原有的医药制造业延伸至医药流通领域。2013年5月，西南合成更名为北大医药。公司董事长李国军同时担任方正证券董事。

　　值得注意的是，北京大学旗下4家A股上市公司，都通过北大方正集团实施控制，北大方正另有方正控股、北大资源两家公司在香港上市。方正集团同时还是北京上市公司中关村的第六大股东，其控制的北大资源科技有限公司，则是云南上市公司博闻科技的第二大股东。

　　方正集团由北京大学于1986年投资创办，目前北京大学持股70%、管理层持股30%。方正集团董事长魏新、首席执行官李友，以善于资本运作闻名资本圈。