该校采取中学推荐和学生自荐两种方式接受考生报名。报名时间为2013年1月15日～2月5日，学生可在网上报名。申请材料要2013年2月5日前以快递方式邮寄至该校招生办公室。学校组织专家组对考生的申请材料进行初审，并于2013年2月27日前，通过该校招生网站或电话公布参加能力测试学生名单。

　　能力测试仍采用笔试的形式，时间为3月10日（周日），我省的测试地点在省实验中学。参加该校自主选拔复试的考生，须在高考志愿提前批次填报该校。

　　2012年，南科大在我省招生20人。记者发现，2012年能力测试主要考查考生的记忆力、想象力、注意力和洞察力等综合能力，而2013年能力测试除了考查以上四方面能力，还须考查考生人文科学素养。南科大称，一般情况下，考生高考成绩需达到本科一批录取最低控制分数线。

　　南科大在录取时按理工大类招生，具体专业分类仅为报考参考和基本程序。新生入学后不分专业，大一、大二主要以基础科学课程为主，大三时再根据学生的兴趣和能力选择专业。

　　南科大学子的“零学费”入读一直是其他高校学子羡慕的对象，这种“好福利”将继续惠及下一批新生。今年，该校将为2013级全体新生设立奖学金，每人6000元/年，连续四年，抵消学费，这意味着所有新生将“零学费”就读南科大。另外，该校也设有国家奖学金等多种奖学金。家庭生活困难的学生除了可以申请免除学费外，还可以申请最高额度达1万元/学年的助学金。