南开大学积极构建和发展适应21世纪经济社会发展和人才培养需要的学科体系，现拥有71个本科专业，206个硕士点，117个博士点，16个一级学科博士学位授权点，17个博士后科研流动站，18个国家级重点学科，48个省市级重点学科，1个国家重点实验室，14个省部级重点实验室，1个国家工程中心，8个国家基础学科人才培养和科学研究基地，1个文化素质教育基地，6个教育部人文社会科学重点研究基地，7个“985”工程哲学社会科学创新基地，4个“985”工程科技创新平台，以重点学科建设为龙头，带动了学科结构的调整和教育资源的整合，实现了学科结构的进一步优化和新兴学科、交叉学科、应用学科的快速发展，形成了各具特色的学科发展思路。

　　南开大学占地162万平方米，建筑面积117万平方米，校园网络设施先进，图书馆藏书329万册。除主校区外，还建有迎水道校区(天津市内)、泰达学院(天津经济技术开发区)、深圳金融工程学院(深圳市)、云南研究院(昆明)，以及在马里兰大学成立的设在美国的第一个孔子学院，形成了一校多区、合理配置、协调互动、全面发展的格局。按照“独立办学、紧密合作”的原则，与天津大学全面合作办学。

　　南开大学发展总的目标是:经过十年左右的努力，把南开大学建设成为规模适度、结构合理、特色鲜明、国内外知名的高水平大学，在教育质量、学术水平和整体办学实力上有显著提高，某些优势学科达到国际先进水平，成为我国高层次创造性人才培养和知识创新的重要基地。再经过几个“五年计划”的艰苦奋斗，力争步入世界一流大学行列。